Le SPM est chargé d'intervenir en missions ponctuelles lors d'événements graves et éprouvants (opérations extérieures ou toute autre situation critique) au cours desquels un groupe ou un équipage de la marine serait confronté aux aléas d'un traumatisme psychique afin d'en prévenir les éventuelles complications pathologiques (interventions à la demande de la formation, de la direction du personnel militaire de la marine (DPMM) ou de l'état-major de la marine (EMM).

Par ailleurs, le maintien en condition physique pendant la mission est d’une extrême importance. Les bâtiments disposent d’équipements à bord. Il appartient au commandement d’en faciliter l’utilisation.